Corso di laurea

biotecnologie molecolari

Università degli studi di Firenze · 15 materie · 2 file condivisi

Il ruolo emergente delle biotecnologie in numerosi settori, sia produttivi che di servizio, richiede la preparazione di professionisti in grado di gestire i sistemi biologici per la produzione di sostanze chimiche, materiali e energia. Il Corso di Laurea Ecco tutti i dettagli sul corso di laurea selezionato. Sul UniDocs troverai gli appunti condivisi dagli altri studenti del tuo corso di laurea, ordinati per materia. Ricordati che per poter visualizzare il materiale devi essere registrato al sito e possedere un numero di crediti sufficiente.

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Materie del corso

ANALISI DEI PROCESSI BIOLOGICI CON APPROCCIO BIOINFORMATICO 1° anno · 1° semestre · 6 CFU · BIOS-08/A · 0 file

Conoscenze acquisite: Il corso offre una trattazione dettagliata delle proprietà e delle funzioni delle principali molecole biologiche che mediano processi biologici di base, nonché le tecniche per la loro determinazione…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze acquisite:
Il corso offre una trattazione dettagliata delle proprietà e delle funzioni delle principali molecole biologiche che mediano processi biologici di base, nonché le tecniche per la loro determinazione da un punto di vista -omico. Inoltre offre la corretta prospettiva per l'analisi bioinformatica dei processi a livello di sistema utilizzando le più moderne tecniche di indagine.
Competenze acquisite:
Lo studente imparerà gli approcci le metodologie più appropriate per lo studio di processi biologici complessi. Inoltre imparerà l'utilizzo della bioinformatica e dei linguaggi di programmazione di base per l'ottenimento e l'integrazione dei dati (BASH, perl, R, Bioconductor).
Capacità acquisite:
Utilizzo di strumenti bioinformatici per analizzare dati -omici ed estrarre informazioni biologiche rilevanti; cercare e investigare pathway metabolici e di segnalazione conspecifiche metodiche analitiche. Conoscenza di bioprocessi fondamentali in organismi diversi.
Conoscenza e comprensione:
cc2: conoscenze di base ed avanzate di genomica strutturale, comparata e funzionale, conoscenze di base in metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca2: impostare in autonomia un protocollo sperimentale per le analisi omiche, un protocollo bioinformatico per l’analisi dei dati risultanti, e derivarne le conseguenze biologiche a livello di sistema
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Analisi di sequenze biologiche.
Analisi funzionale di dati high-throughput. Sistemi di integrazione. Applicazioni in genomica, metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica. Statistica univariata e multivariata applicata con R. Analisi di pathway metabolici e di regolazione. Flux Balance Analysis. Analisi dei network: teoria ed esempi funzionali.

Modalità d'esame

L'esame prevede un colloquio orale volto a verificare la padronanza
dei concetti descritti durante il corso e la capacità dello studente di applicare le conoscenze acquisite ad alcuni problemi pratici e sperimentali.
Non sono previste prove intermedie ma saranno predisposti questionari di autovalutazione (che NON saranno oggetto di valutazione).
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

Alberts et al. BIOLOGIA MOLECOLARE DELLA CELLULA Zanichelli
Citterich et al. FONDAMENTI DI BIOINFORMATICA - Zanichelli
Materiale di supporto a cura del docente

Codice insegnamento B029077

BIOFISICA CELLULARE E MOLECOLARE 1° anno · 2° semestre · 6 CFU · BIOS-06/A · 0 file

Conoscenze: Forze e fenomeni di diffusione a livello cellulare e molecolare Esempi di metodologie biofisiche e applicazioni allo studio di problemi fisiologici Competenze acquisite Uso dei metodi di analisi di segnali…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze:
Forze e fenomeni di diffusione a livello cellulare e molecolare
Esempi di metodologie biofisiche e applicazioni allo studio di problemi fisiologici
Competenze acquisite
Uso dei metodi di analisi di segnali periodici e di simulazioni.
Capacità acquisite al termine del corso:
Sviluppo della capacità di inquadrare un problema biologico e di individuare le tecniche e le metodologie per una sua modellizzazione quantitativa.

Programma

Il mondo a livello microscopico: forze e fenomeni di diffusione. Elementi di fisiologia cellulare. Serie e trasformata di Fourier applicate allo studio dei segnali biologici. Esempi di studi strutturali a bassa e ad alta risoluzione.

Modalità d'esame

L'esame prevede un colloquio orale volto a verificare la padronanza dei concetti acquisiti, in particolare nella comprensione dei fenomeni su scala microscopica. Sarà inoltre verificata la capacità di valutare gli ambiti di applicazione e i limiti di alcune delle tecniche biofisiche studiate.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

J. Howard: Mechanics of motor proteins and the cytoskeleton - Sinauer Ass. Inc.
H.C. Berg: Random walks in Biology - Princeton University Press
Taglietti-Casella: Fisiologia e biofisica delle cellule - EdiSES

Codice insegnamento B029089

BIOTECNOLOGIE APPLICATE A CELLULE EUCARIOTE CON LABORATORIO 1° anno · 2° semestre · 6 CFU · BIOS-10/A · 1 file

Conoscenze e comprensione Conoscenze aggiornate sui metodi di coltura e di manipolazione di lieviti, cellule di insetto, linee cellulari di mammifero, cellule staminali e cellule tumorali, al fine di apprendere i loro…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze e comprensione
Conoscenze aggiornate sui metodi di coltura e di manipolazione di lieviti, cellule di insetto, linee cellulari di mammifero, cellule staminali e cellule tumorali, al fine di apprendere i loro principali ambiti biotecnologici di applicazione (cc1).
Capacità di applicare conoscenze e comprensione.
Individuare il tipo cellulare opportuno per l’espressione di proteine eterologhe; progettare un editing genomico in uno specifico contesto sperimentale (ca1).
Autonomia di Giudizio:
Capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale (ag1).
Capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie (ag2).
Capacità di Comunicazione:
Capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti (ac1).
Capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti (ac2).
Capacità di Apprendimento:
Consultazione di banche dati specialistiche (ap1)
Apprendimento di tecnologie innovative (ap2).
Acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze (ap3).

Programma

Sistemi cellulari: lieviti, cellule di insetto, linee cellulari di mammifero, cellule staminali, cellule tumorali. Mantenimento di colture in vitro. Colture cellulari bidimensionali e tridimensionali. Mantenimento e differenziamento di cellule staminali. Espressione di proteine in lievito, in cellule di insetto, in cellule di mammifero. Selezione di linee cellulari stabili. Editing genetico. Attività seminariale di gruppo.
Esercitazioni in laboratorio.

Modalità d'esame

Verranno valutati il rigore e la chiarezza dell'esposizione, la capacità di inquadrare i vari argomenti nei rispettivi contesti e di collegarli tra loro.
Saranno pertanto verificate le conoscenze (cc) e competenze acquisite (ca).
Lo studente deve saper discutere gli argomenti trattati durante l'insegnamento (ag, ac e ap).
I metodi previsti di accertamento delle conoscenze e competenze acquisite sono:
a) per i contenuti delle lezioni frontali è previsto un esame orale. Il punteggio massimo raggiungibile è 27/30, che sarà integrato dai punti conseguiti nell’attività di laboratorio e seminariale (massimo 3).
b) per la parte di laboratorio è prevista la stesura di una relazione con descrizione ed interpretazione dei risultati delle esperienze proposte.
Tabella docimologica di valutazione:
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

Materiale didattico fornito dal docente e presente sulla piattaforma e-learning dell’università (accesso degli studenti iscritti al corso mediante
le proprie credenziali).

Codice insegnamento B029079

GENOMICA E BIOLOGIA DEI SISTEMI 1° anno · 1° semestre · 6 CFU · BIOS-14/A · 0 file

Conoscenza e Comprensione cc2: conoscenze di base ed avanzate di genomica strutturale, comparata e funzionale, conoscenze di base in metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica cc5: analisi delle reti di…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenza e Comprensione
cc2: conoscenze di base ed avanzate di genomica strutturale, comparata e funzionale, conoscenze di base in metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di Applicare Conoscenza e Comprensione
ca2: impostare in autonomia un protocollo sperimentale per le analisi omiche, un protocollo bioinformatico per l’analisi dei dati risultanti, e derivarne le conseguenze biologiche a livello di sistema
Autonomia di Giudizio
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità di Comunicazione
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di Apprendimento
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Contenuto genico nei genomi di Archei, Batteri ed Eucarioti. Genomica comparata. Evoluzione dei geni. Principi di analisi di genomica funzionale. Trascrittomica comparata. Analisi statistica della variabilità genomica. La genomica ambientale: scoperte ed applicazioni. Sistemi complessi. Biologia dei sistemi. Analisi mediante grafi. Modelli metabolici

Modalità d'esame

Verifica delle conoscenze e delle competenze (problem solving) mediante test scritto con domande a risposta chiusa ed aperta della durata di 1 h.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

A.M. Lesk, Introduction to genomics. Oxford University Press, 2017 Voit. A First Course in Systems Biology (3e). Taylor and Francis Snyder. Bacterial Genetics and Genomics (2e). Taylor and Francis Qualunque testo aggiornato di genetica molecolare. Materiale aggiuntivo sulla piattaforma Moodle

Codice insegnamento B029078

IMMUNOLOGIA E TECNICHE IMMUNOLOGICHE 1° anno · 1° semestre · 6 CFU · MEDS-02/A · 0 file

1) Acquisizione delle principali nozioni di immunologia generale e immunopatologia 2) Acquisizione delle competenza teoriche e pratiche nelle principali tecniche immunologiche 3) Acquisizione delle competenze…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

1) Acquisizione delle principali nozioni di immunologia generale e immunopatologia 2) Acquisizione delle competenza teoriche e pratiche nelle principali tecniche immunologiche 3) Acquisizione delle competenze teorico/pratiche utilizzate nell'industria biotecnologica applicata all'immunologia

Programma

La risposta immunitaria naturale e acquisita. Le immunoglobuline: produzione e ingegnerizzazione di anticorpi e frammenti anticorpali. Le cellule dell'immunità naturale e dell'immunità acquisita: aspetti morfologici e molecolari. Aspetti molecolari e biofisici della attivazione linfocitaria. Basi biologiche e meccanismi patogenetici delle malattie da ipersensibilità, delle malattie autoimmuni e delle immunodeficienze Le principali tecniche immunologiche (lezioni teoriche e pratiche)

Modalità d'esame

Presentazione di un elaborato scritto relativo alle esercitazioni di laboratorio svolte. Analisi scritta di una pubblicazione scientifica. Prova orale sugli argomenti oggetto delle lezioni.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

AK Abbas et al.: Immunologia Cellulare e Molecolare (IX Ed)
K Muprhy: Immunobiologia di Yaneway

Codice insegnamento B007166

INGLESE C1 (COMPRENSIONE SCRITTA E ORALE) 1° anno · 3 CFU · 0 file
INTERAZIONI BIOMOLECOLARI: METODI IN SILICO ED IN VITRO 1° anno · 12 CFU · CHEM-03/A · 0 file

Conoscenze: Conoscenza dei fattori termodinamici e cinetici che guidano le interazioni biomolecolari. Conoscenze di base sui principali metodi sperimentali per lo studio di complessi biomolecolari. Competenze acquisite…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze:
Conoscenza dei fattori termodinamici e cinetici che guidano le interazioni biomolecolari.
Conoscenze di base sui principali metodi sperimentali per lo studio di complessi biomolecolari.
Competenze acquisite
Comprensione di testi scientifici specialistici relativi allo studio di interazioni biomolecolari, sia in termini di descrizione delle proprietà funzionali e strutturali delle molecole coinvolte che della metodologia utilizzata.
Risultati di apprendimento (Descrittori di Dublino)
Capacità acquisite al termine del corso:
Capacità di valutare in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di determinate interazioni biomolecolari e di progettare un adeguato approccio sperimentale per la risoluzione di problemi pratici.
Conoscenza e comprensione:
cc1: basi metodologiche e scientifiche delle tecnologie delle colture cellulari e delle proteine ricombinanti
cc2: conoscenze di base ed avanzate di genomica strutturale, comparata e funzionale, conoscenze di base in metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica
cc3: metodologie di progettazione razionale di molecole mimetiche di sostanze naturali di interesse biologico, progettazione e sintesi di biomolecole e nanosistemi e loro funzionalizzazione per l'ottenimento di sonde molecolari e farmaci
cc4: analisi delle molecole biologiche e dei sistemi biologici in genere attraverso l'uso di opportuni metodi fisici (spettroscopia, microscopia, e tecniche strutturali)
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca1: orientarsi correttamente sulla scelta delle più opportune procedure sperimentali per la generazione di linee cellulari, e per la produzione di proteine, vaccini e anticorpi monoclonali ricombinanti
ca2: impostare in autonomia un protocollo sperimentale per le analisi omiche, un protocollo bioinformatico per l’analisi dei dati risultanti, e derivarne le conseguenze biologiche a livello di sistema
ca3: progettare la sintesi di collezioni di molecole con attività biologica sulla base degli studi teorici di docking e drug discovery, progettare la trasformazione di biomolecole complesse attraverso metodologie di bioconiugazione per ottenimento di sonde molecolari
ca4: acquisire i principi di funzionamento delle tecniche biofisiche e la capacità di individuare le più opportune per specifiche applicazioni pratiche
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico specifico, la progettazione di inibitori per le interazioni alla base di processi patologici, la descrizione di fenomeni complessi quali il trasporto attraverso le membrane e la motilità cellulare e tissutale
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Il corso tratta gli aspetti sperimentali e teorici relativi alle interazioni che coinvolgono proteine, acidi nucleici ed altre biomolecole. L’identificazione, la quantificazione e il controllo della formazione di tali complessi sono aspetti chiave per aree quali lo sviluppo di farmaci, il signalling cellulare, l’elucidazione di pathway biosintetici, la comprensione della catalisi enzimatica.

Modalità d'esame

L'esame prevede un colloquio orale volto a verificare la padronanza
dei concetti strutturali, cinetici e termodinamici che regolano le
interazioni biomolecolari e la conoscenza delle principali
metodologie sperimentali illustrate nei due moduli in cui si
compone il corso. Sarà verificata la comprensione e la capacità di
analisi critica delle attività svolte durante le esercitazioni di
laboratorio. Durante il colloquo sarà infine accertata la capacità
dello studente di applicare le conoscenze acquisite ad alcuni
problemi pratici proposti dai docenti.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

Non esistono testi di riferimento specifici.
Saranno forniti a lezione capitoli di libri e review article sui soggetti trattati.

Codice insegnamento B015921

METODI OTTICI IN BIOLOGIA CON LABORATORIO 1° anno · 2° semestre · 6 CFU · PHYS-03/A · 0 file

Ampliare le conoscenze degli studenti nel campo delle tecniche di microscopia avanzate utilizzate nelle moderne applicazioni biologiche e biomediche. Conoscenza e comprensione: cc3: metodologie di progettazione razionale…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Ampliare le conoscenze degli studenti nel campo delle tecniche di microscopia avanzate utilizzate nelle moderne applicazioni biologiche e biomediche.
Conoscenza e comprensione:
cc3: metodologie di progettazione razionale di molecole mimetiche di sostanze naturali di interesse biologico, progettazione e sintesi di biomolecole e nanosistemi e loro funzionalizzazione per l'ottenimento di sonde molecolari e farmaci
cc4: analisi delle molecole biologiche e dei sistemi biologici in genere attraverso l'uso di opportuni metodi fisici (spettroscopia, microscopia, e tecniche strutturali)
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca4: acquisire i principi di funzionamento delle tecniche biofisiche e la capacità di individuare le più opportune per specifiche applicazioni pratiche
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico specifico, la progettazione di inibitori per le interazioni alla base di processi patologici, la descrizione di fenomeni complessi quali il trasporto attraverso le membrane e la motilità cellulare e tissutale
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Luce e sue proprietà. Fondamenti di ottica. Molecole e interazione radiazione-materia. Microscopia ottica. Manipolazione ottica. Metodi di marcatura mediante sonde fluorescenti. Microscopia a scansione laser. Microscopia vibrazionale. Super-risoluzione. Applicazioni biologiche.

Modalità d'esame

Esame orale consistente nella presentazione di un articolo scientifico sulle tematiche affrontate a lezione e verifica della comprensione delle stesse.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

  • J. Mertz "Introduction to Optical Microscopy"
  • "An introduction to single molecule biophysics", edited by Yuri L. Lyubchenko

Codice insegnamento B015929

METODOLOGIE DI SINTESI DI MOLECOLE BIOATTIVE 1° anno · 1° semestre · 6 CFU · CHEM-05/A · 0 file

Conoscenze: Scopo del corso è quello di fornire una conoscenza dettagliata della sintesi e proprietà delle principali classi di biomolecole e del loro comportamento chimico, includendo una panoramica sulle…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze:
Scopo del corso è quello di fornire una conoscenza dettagliata della sintesi e proprietà delle principali classi di biomolecole e del loro comportamento chimico, includendo una panoramica sulle nanotecnologie.
Competenze:
Lo studente sarà capace di progettare una sintesi peptidica e la creazione di librerie di composti con potenziale attività biologica. Inoltre lo studente saprà riconoscere nelle principali biomolecole (peptidi e proteine, zuccheri e polisaccaridi, acidi nucleici ed oligonucleotidi) i gruppi funzionali più adatti alla marcatura con fluorofori o radionuclidi e le strategie di sintesi impiegabili per esprimere su di esse gruppi funzionali non normalmente presenti. Conoscerà le principali classi di fluorofori e le relative funzionalità per la bioconiugazione. Inoltre lo studente acquisterà competenza sulla biofunzionalizzazione di nanoparticelle di diversa natura e sull’applicazione di nanosistemi biofunzionali in campo biomedico.
Capacità acquisite al termine del corso:
Capacità di valutare in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la sintesi peptica e la marcatura di biomolecole complesse. Conoscenze di base per la progettazione di nanomateriali biofunzionali per risolvere problemi biologici.
Conoscenza e comprensione:
cc3: metodologie di progettazione razionale di molecole mimetiche di sostanze naturali di interesse biologico, progettazione e sintesi di biomolecole e nanosistemi e loro funzionalizzazione per l'ottenimento di sonde molecolari e farmaci
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca3: progettare la sintesi di collezioni di molecole con attività biologica sulla base degli studi teorici di docking e drug discovery, progettare la trasformazione di biomolecole complesse attraverso metodologie di bioconiugazione per ottenimento di sonde molecolari
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico specifico, la progettazione di inibitori per le interazioni alla base di processi patologici, la descrizione di fenomeni complessi quali il trasporto attraverso le membrane e la motilità cellulare e tissutale
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Concetti di base della sintesi organica. Metodi fisici di caratterizzazione di molecole bioattive. Sintesi dei peptidi in soluzione e in fase solida. Chimica combinatoria. Analisi dei peptidi e screening biologico. Tecniche di bioconiugazione. Principi e applicazioni di imaging molecolare. Carboidrati, principali gruppi protettori e reazioni. Nanoparticelle (NP): definizione, classificazione, cenni di sintesi e caratterizzazione chimico-fisica. Applicazione di NP in teranostica

Modalità d'esame

L'esame prevede una prova orale volta ad accertare la comprensione e la capacità di esporre in modo chiaro e appropriato gli argomenti oggetto del corso. Verrà anche valutata la capacità di applicare le conoscenze acquisite ad alcuni problemi pratici (progettazione di sintesi di molecole biologicamente attive o la trasformazione dei gruppi funzionali presenti sulle biomolecole per la marcatura con gli agenti idonei).
Verranno valutati il rigore e la chiarezza dell'esposizione, la capacità di inquadrare i vari argomenti nei rispettivi contesti e di collegarli tra loro.
Saranno pertanto verificate le conoscenze (cc) e competenze acquisite (ca).
Lo studente deve saper discutere gli argomenti trattati durante l'insegnamento (ag, ac e ap).
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

Greg T. Hermanson, Bioconjugate Techniques, Academic Press USA
Ravin Narain, Chemistry of Bioconjugates: Synthesis, Characterization, and Biomedical Applications, John Wiley & Sons
Carbohydrate Chemistry (Oxford Chemistry Primers) by B. G. Davis and A. J. Fairbanks
Materiale fornito dal docente.

Codice insegnamento B015924

PROTEOMICA 1° anno · 1° semestre · 6 CFU · BIOS-07/A · 1 file

Il corso è indirizzato a far acquisire allo studente le capacità di scegliere l’adeguato approccio e le corrette metodiche per l’isolamento del proteoma da campioni biologici e per la successiva analisi proteomica mirata…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Il corso è indirizzato a far acquisire allo studente le capacità di scegliere l’adeguato approccio e le corrette metodiche per l’isolamento del proteoma da campioni biologici e per la successiva analisi proteomica mirata all'identificazione di proteine e alla loro caratterizzazione nel contesto studiato.
Al termine del corso gli studenti avranno la capacità di predisporre esperimenti proteomici utilizzando strategie e tecniche sia di base che avanzate.
Conoscenza e comprensione:
cc1: basi metodologiche e scientifiche delle tecnologie delle colture cellulari e delle proteine ricombinanti
cc2: conoscenze di base ed avanzate di genomica strutturale, comparata e funzionale, conoscenze di base in metagenomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica
cc4: analisi delle molecole biologiche e dei sistemi biologici in genere attraverso l'uso di opportuni metodi fisici (spettroscopia, microscopia, e tecniche strutturali)
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca1: orientarsi correttamente sulla scelta delle più opportune procedure sperimentali per la generazione/selezione di linee cellulari e per la produzione di proteine ricombinanti, con l’obiettivo di sviluppare studi proteomici mirati.
ca2: impostare in autonomia un protocollo sperimentale per le analisi proteomiche e per le analisi dei dati risultanti, e derivarne le conseguenze biologiche a livello di sistema
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico specifico.
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Il Proteoma. Tecniche elettroforetiche. Elettroforesi bidimensionale. Tecniche cromatografiche “multidimensionali”. Spettrometria di massa delle proteine. Identificazione di proteine. Metodi per il sequenziamento polipeptidico. Metodi per l’analisi proteomica differenziale. Modificazioni covalenti delle proteine e loro analisi. Proteomica differenziale e funzionale. Analisi in vitro e in vivo dei complessi proteici.

Modalità d'esame

Lo studente verrà valutato con un colloquio orale sugli argomenti trattati durante le lezioni e durante le attività di laboratorio. Verranno valutati il rigore e la chiarezza dell'esposizione, la conoscenza e l’approfondimento degli argomenti chiesti, la capacità di inquadrare i vari argomenti nei rispettivi contesti e di collegarli tra loro.
Saranno pertanto verificate le conoscenze (cc) e competenze acquisite (ca).
Lo studente deve saper discutere gli argomenti trattati durante l'insegnamento (ag, ac e ap).
Tabella docimologica di valutazione:
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione. La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

"Proteomica", Alberio T., Fasano M., Roncada P., EdiSES Università.
"Biochimica e biologia molecolare. Principi e tecniche" di K. Wilson and J. Walker. Raffaello Cortina editore
Reviews e articoli scientifici sui principali argomenti

Codice insegnamento B026332

DRUG DISCOVERY 2° anno · 6 CFU · CHEM-05/A · 0 file

Conoscenze: Principi del drug discovery Competenze acquisite: Conoscenze su base teorica e pratica per la progettazione razionale di molecole bioattive per lo sviluppo di farmaci. di nuova sintesi e mimetiche di sostanze…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze:
Principi del drug discovery
Competenze acquisite:
Conoscenze su base teorica e pratica per la progettazione razionale di molecole bioattive per lo sviluppo di farmaci. di nuova sintesi e mimetiche di sostanze naturali di interesse biologico.
Capacità acquisite al termine del corso:
progettazione e valutazione di interazioni ligando-proteina a livello molecolare.
Conoscenza e comprensione:
cc3: metodologie di progettazione razionale di molecole mimetiche di sostanze naturali di interesse biologico, progettazione e sintesi di biomolecole e nanosistemi e loro funzionalizzazione per l'ottenimento di sonde molecolari e farmaci
cc4: analisi delle molecole biologiche e dei sistemi biologici in genere attraverso l'uso di opportuni metodi fisici (spettroscopia, microscopia, e tecniche strutturali)
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche, dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca4: acquisire i principi di funzionamento delle tecniche biofisiche e la capacità di individuare le più opportune per specifiche applicazioni pratiche
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico specifico, la progettazione di inibitori per le interazioni alla base di processi patologici, la descrizione di fenomeni complessi quali il trasporto attraverso le membrane e la motilità cellulare e tissutale
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della relazione finale.
ag2: capacità di determinare giudizi autonomi, in relazione alla gestione di progetti di lavoro, all'uso della strumentazione e all'interazione con il personale tecnico addetto ed a temi sociali ed etici connessi al settore delle biotecnologie.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap2: apprendimento di tecnologie innovative
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle conoscenze

Programma

Introduzione al drug discovery; progettazione e sintesi di molecole bioattive; chimica combinatoria; molecular modeling; principi di analisi conformazionale; visualizzazione di macromolecole; principi ed applicazioni di docking molecolare; principi di brevettazione; casi-studio in drug discovery, esercitazioni di docking molecolare e chemoinformatica.

Modalità d'esame

L'esame consiste in due attività di verifica:
1-Produzione di una relazione su un articolo scientifico scelto dallo studente da inviare al docente prima dell'esame finale.
2-Esame scritto di due ore con domande aperte volto a verificare la conoscenza dei principi del drug discovery, le conoscenze teoriche e pratiche per la progettazione razionale di molecole di interesse biologico.
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

selezione di articoli, capitoli di libri e appunti forniti dal docente

Codice insegnamento B015930

MODELLISTICA APPLICATA A MOLECOLE DI INTERESSE BIOLOGICO 2° anno · 6 CFU · CHEM-02/A · 0 file

Conoscenze: Il corso prevede tre crediti per lezioni teoriche frontali e tre crediti da svolgersi in laboratorio informatico. La parte in aula fornisce le basi termodinamiche nell'interazione tra molecole diinteresse…

Scheda dell'insegnamento

Obiettivi formativi

Conoscenze: Il corso prevede tre crediti per lezioni teoriche frontali e tre crediti da svolgersi in laboratorio informatico. La parte in aula fornisce le basi termodinamiche nell'interazione tra molecole diinteresse biologico e la conoscenza teorica dei principali strumenti bioinformatici nell'ambito del Docking Molecolare. In laboratorio lo studente applichera', in esercitazioni individuali, gli strumenti teorici acquisiti durante il corso, implementando su una piattaforma di tipo unix, procedure computazionali volte al calcolo di costanti di equilibrio per reazioni di interesse biologico.
Conoscenza e comprensione:
cc3: metodologie di progettazione razionale di molecole mimetiche di sostanze naturali di
interesse biologico, progettazione e sintesi di biomolecole e nanosistemi e loro
funzionalizzazione per l'ottenimento di sonde molecolari e farmaci
cc5: analisi delle reti di interazioni fra biomolecole e delle caratteristiche chimiche,
dinamiche e strutturali che determinano tali interazioni
Capacità di applicare conoscenza e comprensione:
ca3: progettare la sintesi di collezioni di molecole con attività biologica sulla base degli
studi teorici di docking e drug discovery, progettare la trasformazione di biomolecole
complesse attraverso metodologie di bioconiugazione per ottenimento di sonde molecolari
ca5: stabilire in modo autonomo e consapevole i migliori approcci metodologici per la
caratterizzazione di interazioni biomolecolari rilevanti per un problema biochimico
specifico, la progettazione di inibitori per le interazioni alla base di processi patologici, la
descrizione di fenomeni complessi quali il trasporto attraverso le membrane e la motilità
cellulare e tissutale
Autonomia di giudizio:
ag1: capacità di raccogliere ed interpretare dati sperimentali o tecnici, sviluppata
principalmente tramite la didattica seminariale, l'attività di tirocinio e la stesura della
relazione finale.
Capacità comunicative:
ac1: capacità di comunicare informazioni, idee, problemi e soluzioni relativi agli ambiti
delle biotecnologie molecolari e industriali ad interlocutori specialisti
ac2: capacità di comunicare informazioni relative agli ambiti delle biotecnologie molecolari
ed industriali ad interlocutori non specialisti
Capacità di apprendimento:
ap1: consultazione di banche dati specialistiche
ap3: acquisizione di strumenti conoscitivi avanzati per l'aggiornamento continuo delle
conoscenze

Programma

Principi termodinamici del riconoscimento molecolare. Energia libera, energia configurazionale ed entropia nell'interazione farmaco proteina. Approccio termodinamico statistico al calcolo della costante di equilibrio farmaco-recettore e basi termodinamiche del Docking Molecolare. Force fields e calcolo dell'energia con metodi a solvente implicito. Esercitazioni individuali di laboratorio in aula informatica: determinazione della costante di equilibrio farmaco-recettore con metodi di Docking.

Modalità d'esame

Esame Orale volto alla verifica dell'apprendimento delle basi teoriche dell'interazione farmaco proteina e della padronanza degli strumenti tecnici-applicativi per il Docking Molecolare acquisiti in laboratorio
Tabella docimologica di valutazione
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati, livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina, capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.
Verranno valutati il rigore e la chiarezza dell'esposizione, la capacità di inquadrare i vari
argomenti nei rispettivi contesti e di collegarli tra loro.
Saranno pertanto verificate le conoscenze (cc) e competenze acquisite (ca).
Lo studente deve saper discutere gli argomenti trattati durante l'insegnamento (ag, ac e
ap).
Tabella docimologica di valutazione:
Insufficiente
Valutazione negativa dovuta a gravi errori concettuali, comprensione frammentaria o nulla
degli argomenti trattati, incapacità di applicare le conoscenze, gravi lacune e mancanza di
autonomia.
18–22
Valutazione sufficiente o più che sufficiente dovuta a conoscenza elementare degli
argomenti, presenza di alcuni errori, capacità di affrontare solo compiti semplici o guidati,
livello base di autonomia.
23–25
Valutazione discreta dovuta a comprensione soddisfacente degli argomenti, capacità di
applicare correttamente le conoscenze a contesti noti e di affrontare gli esercizi in modo
autonomo con qualche imprecisione, con un soddisfacente livello di autonomia e
competenza operativa.
26–28
Valutazione buona o molto buona, dovuta a solida comprensione teorica della disciplina,
capacità di collegare concetti, risolvere problemi e proporre analisi critiche, di svolgere
compiti complessi in modo autonomo, preciso ed efficace, con un buon livello di
autonomia e competenza operativa.
29–30 e Lode
Valutazione eccellente o ottima, dovuta a conoscenze complete, approfondite e ben
strutturate, capacità di operare in modo autonomo e flessibile, anche in contesti complessi
o nuovi, di utilizzare il linguaggio disciplinare in modo appropriato, preciso e articolato, di
evidenziare capacità critiche, originalità e rigore nell’esposizione e nell’applicazione.
La Lode è attribuita a elaborati o prestazioni che si distinguono per brillantezza e
originalità, anche al di là delle aspettative curricolari.

Testi di riferimento

Dispense a cura del docente

Codice insegnamento B019097

PROVA FINALE: LAVORO SPERIMENTALE 2° anno · 18 CFU · 0 file
PROVA FINALE: SCRITTURA E DISCUSSIONE 2° anno · 6 CFU · 0 file
TIROCINIO 2° anno · 12 CFU · 0 file

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