Fuctional genomics (Prof. Martin Kater)
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Di cosa parla
- La genomica funzionale mira a comprendere la funzione dei geni e delle parti del genoma, integrandosi con trascrittomica, proteomica e metabolomica come tecniche omiche per analizzare sia singoli geni che interi genomi.
- I principali ostacoli nello studio genomico includono l'alto costo delle infrastrutture necessarie, la breve vita media delle apparecchiature e la necessità di una stretta collaborazione interdisciplinare tra ricercatori e teorici.
- La bioinformatica utilizza algoritmi matematici e tecnologie dell'informazione per gestire grandi volumi di dati biologici, permettendo il passaggio dall'osservazione dei sistemi naturali alla predizione del loro comportamento evolutivo.
- Il sequenziamento di Sanger, basato sull'uso di ddNTP marcati con fluorofori diversi, ha permesso il sequenziamento dei primi genomi completi ma è stato superato da tecniche più veloci per analisi high throughput.
- Il pirosequenziamento sfrutta il rilascio di pirofosfato durante la sintesi del DNA per generare segnali di chemiluminescenza, consentendo di determinare la sequenza nucleotidica senza l'uso di gel di elettroforesi tradizionali.
- Le tecniche di sequenziamento moderno offrono vantaggi quali l'amplificazione tramite PCR, il riconoscimento di introni ed esoni e lo studio dell'evoluzione genomica, supportando l'approccio della system biology per modellare reti biologiche complesse.
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