Appunti VERIFICATO
Molecular and cellular microbiology
Università degli Studi di Milano molecular biotechnology and bioinformatics - biotecnologie molecolari e bioinformatica 2021
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Di cosa parla
- Metagenomics e metatranscriptomi per caratterizzare comunità microbiche: utilizzano approcci come DNA-seq, RNA-seq, Tareted DNA-seq e NGS per analisi di alto throughput.
- Tecnologie di sequenziamento: Sanger (1970), Next Generation Sequencing (2005) e Long-Read Sequencing (2011); ciascuna ha specifiche caratteristiche e limiti.
- Trimmig per migliorare qualità dati: filtraggio letture di bassa qualità, rimozione adattatori e trimpaggio.
- Meta-tassonomica e metagenomica: identificazione specie, quantificazione abbondanza, comprensione ruoli funzionali e interazioni; utilizzo 16s rRNA per classificare batteri.
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