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biologia

Università degli studi di Siena chimica e tecnologia farmaceutiche 2020
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Di cosa parla

  • Dogma Centrale: L'informazione genetica "scorre" dal DNA all'RNA e poi alle proteine. Il DNA può replicarsi. L'informazione dalle proteine non torna agli acidi nucleici (Francis Crick). I retrovirus sono un'eccezione, dove l'RNA codifica per il DNA tramite trascrizione inversa.
  • Trascrizione genica: È il processo di sintesi dell'RNA a partire da uno stampo di DNA. L'RNA trascritto è complementare al filamento stampo del DNA e uguale al filamento codificante (con U al posto di T). La sintesi dell'RNA avviene in direzione 5'->3' e non richiede un innesco.
  • Requisiti per la Trascrizione:
    • DNA stampo (template DNA).
    • RNA polimerasi.
    • Ribonucleosidi trifosfati (ATP, GTP, CTP, UTP).
  • Trascrizione nei Procarioti:
    • Utilizzano una sola RNA polimerasi, che si lega al promotore con l'aiuto del fattore sigma.
    • I promotori batterici tipici hanno sequenze consenso a -35 (es. TTGACA) e -10 (es. TATAAT) rispetto al sito di inizio (+1).
    • La trascrizione termina in sequenze ricche di CG o con l'intervento del fattore rho (ρ).
    • Gli mRNA batterici subiscono pochi eventi di maturazione e vengono tradotti non appena trascritti (trascrizione e traduzione accoppiate).
    • La regolazione dell'espressione genica avviene spesso in fase iniziale e gruppi di geni (operoni) possono essere controllati da un unico promotore.
    • Gli rRNA procariotici (16S, 23S, 5S) e tRNA (30-40 nucleotidi) sono prodotti dal processamento di un precursore di RNA più lungo.
  • Trascrizione negli Eucarioti:
    • Possiedono tre RNA polimerasi diverse:
      • RNA Polimerasi I: Nel nucleolo, trascrive gli rRNA 18S, 5.8S e 28S (ma non il 5S rRNA). I geni per rRNA sono altamente ripetuti e il grande rRNA precursore è processato per ottenere i singoli rRNA.
      • RNA Polimerasi II: Nel nucleoplasma, trascrive tutti i geni codificanti proteine (mRNA), snRNA, snoRNA e miRNA. È sensibile all'α-amanitina. Richiede fattori generali di trascrizione (TBP, TFIID, TFIIA, TFIIB, TFIIF, TFIIE, TFIIH) che si legano al promotore per avviare la trascrizione. I promotori eucariotici includono spesso una TATA box.
      • RNA Polimerasi III: Nel nucleoplasma, trascrive tRNA, 5S rRNA e scRNA, oltre ad alcuni snRNA. Moderatamente sensibile all'α-amanitina.
    • Maturazione dell'RNA (mRNA eucariotico):
      • Capping: Aggiunta di un cappuccio di 7-metilguanosina all'estremità 5' del trascritto primario.
      • Splicing: Rimozione degli introni (sequenze non codificanti) e giunzione degli esoni (sequenze codificanti). Il pre-mRNA è più lungo dell'mRNA maturo. Gli introni spesso iniziano con GT e terminano con AT. Lo splicing è catalizzato dallo spliceosoma, un complesso di snRNP (snRNP U1, U2, U4/U6, U5) e altre proteine, che forma una struttura a "lariat".
      • Poliadenilazione: Aggiunta di una coda di poli-A (molti residui di adenina) all'estremità 3'.
      • L'mRNA maturo ha una sequenza codificante preceduta da una regione non tradotta 5' (5'UTR) e seguita da una regione non tradotta 3' (3'UTR).
    • Splicing alternativo: Permette la produzione di diverse isoforme proteiche da un singolo gene, variando la combinazione degli esoni in diversi tessuti o stadi di sviluppo.
    • RNA Editing: Modifiche alla sequenza dell'RNA dopo la trascrizione (es. ApoB mRNA).
    • Piccoli RNA regolatori: siRNA e miRNA sono piccole molecole di RNA a doppia catena (21-22 nucleotidi) che regolano l'espressione genica, differiscono per origine e meccanismo d'azione (siRNA pienamente complementari, miRNA parzialmente complementari).
  • Smistamento e Controllo: Negli eucarioti, la trascrizione avviene nel nucleo, seguita da complessi processi di maturazione e smistamento dell'RNA al citoplasma per la traduzione, e meccanismi di degradazione dell'RNA. La regolazione genica eucariotica è complessa e coinvolge modifiche della cromatina (condensata/decondensata), attivatori, repressori e il complesso mediatore.

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