Diversità microbica: divisa in genetica e funzionale; genetica include diversità filogenetica (genetica, genomica) e funzionale (ecologica, metabolica, fisiologica, morfologica).
Microbi: termine comprensivo per batteri, virus, protozoi, alghe unicellulari; dimensioni variano da 20nm a 700µm.
Batteri: organismi procarotici, chemiotrofi (organotrof, litotrof), aerobi o anaerobi; diffusi nell'ambiente e fondamentali per cicli elementari e biodegradazione.
Spore batteriche: forme cellulari specializzate per la sopravvivenza in condizioni avverse, prodotte da Bacillus e Clostridium.
Archaea alofili: vivono ad elevate concentrazioni saline; Halobacterium sintetizza K+ nel citoplasma per mantenere l'equilibrio osmotico.
Lieviti: eucarioti unicellulari, producono spore contenute in aschi (Ascomiceti); ciclo vitale complesso con incrocio sessuale.
Muffe: funghi pluricellulari, chemiotrofi eterotrofi aerobi; diffusi nell'ambiente e importanti per la biotrasformazione di inquinanti organici e metalli pesanti.
Protozoi: eucarioti unicellulari mobili, chemiotrofi eterotrofi aerobi; componenti essenziali dei fanghi attivi di depurazione.
Microalghe: eucarioti unicellulari o coloniali, fotosintetiche autotrofe ossigeniche; diffusi in ambienti acquatici anche estremi.
Rumina: organo del tratto digerente dei ruminanti dove la fibra ingerita viene degradata e fermentata da microrganismi, producendo metano come residuo.
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