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Appunti universitari condivisi: bioinformatics

LM-6 - Biologia - Università degli studi di Bologna

La laurea magistrale in Bioinformatica è volta alla formazione di un esperto adatto a settori specifici della Biologia, Biotecnologia, e Medicina in ambito molecolare. Oggi la ricerca biomedica e biologica necessita continuamente per il suo sviluppo e la sua programmazione di personale con una esperienza interdisciplinare in grado di trarre informazione dalle banche dati esistenti, ma anche di contribuire al loro sviluppo e crescita, al fine di salvaguardare e tramandare un patrimonio unico di informazioni a livello molecolare della nostra specie e di altre. Le applicazioni della Bioinformatica sono disparate ed includono vari settori come risulta dall'insieme di laboratori che danno la loro disponibilità per la formazione di personale nelle diverse discipline. La laurea magistrale in Bioinformatica fornisce pertanto le basi per l'utilizzo e lo sviluppo degli strumenti informatici e bioinformatici al fine di formare esperti altamente qualificati sia per entrare nel mondo del lavoro che per accedere al livello III di istruzione universitaria in Italia e in ambito internazionale: tutta l'offerta formativa infatti è dedicata all'inserimento del formando in un ambito internazionale e in un contesto in fase di crescita per la richiesta di esperti nel settore.
La opportunità di carriera sono quindi molteplici e in ambiti interdisciplinari che comprendono: Analisti per dati biologici, Ingegneri di software dedicato alla biologia, Biologi con capacità computazionali, Bioinformatici, Curatori di banche date di tipo biologico e biotecnologi con capacità informatiche.

Presentazione del Corso di Studio

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• [P938071888] ALGORITHMS AND DATA STRUCTURES FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY [cod. 69443] (1° anno)
• [P826873358] APPLIED GENOMICS [cod. 72847] (1° anno)
  
  [Compiti ed esercitazioni] lezione 3 - 2022 - (pillola free)
  lezione 3
  [Compiti ed esercitazioni] lab 5 - 2022 - (pillola free)
  lab 5
  [Compiti ed esercitazioni] lab 6 - 2022 - (pillola free)
  lab 6
  [Domande d'esame] importante esami - 2023 - (pillola free)
  importante esami
• [P107070866] BIOANALYTICAL PROTEOMICS AND INTERACTOMICS [cod. 66571] (1° anno)
• [P614010163] BIOMEDICAL DATA BASES [cod. 66557] (1° anno)
  
  [Domande d'esame] BDB exam - 2020 - (pillola free)
  BDB final exam 2020 including answers
• [P999775573] DNA/RNA DYNAMICS [cod. 66569] (1° anno)
  
  [Domande d'esame] DRD exam - 2020 - (pillola free)
  Questo documento riassume concetti chiave di bioinformatica, includendo i metodi di linkage per il clustering gerarchico (minimo, massimo, medio) e la loro applicazione nel calcolo delle distanze tra i cluster. Descrive la chimica dell'Illumina Beadchip 450K per l'analisi della metilazione del DNA, differenziando le approcci Infinium 1 e 2. Spiega l'uso del test di Mann Whitney U per identificare geni differenzialmente espressi in dati non-parametrici e non accoppiati. Infine, illustra il MA plot come strumento diagnostico per la normalizzazione dei dati di espressione genica, la valutazione dell'equilibrio tra i colori rosso e verde e l'identificazione di geni regolati.
• [P963537665] INTRODUCTION TO BIG DATA PROCESSING INFRASTRUCTURES [cod. 87809] (1° anno)
• [P953263555] LABORATORY OF BIOINFORMATICS 1 [cod. 66563] (1° anno)
• [P120800225] MOLECULAR PHYLOGENETICS [cod. 72848] (1° anno)
• [P411005135] PROGRAMMING FOR BIOINFORMATICS [cod. 69442] (1° anno)
  
  [Domande d'esame] Final exam Module 3: Di Lena version 1 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions (due to the Covid - online exam) version 1
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena module 3 version 2 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions (due to the Covid - online exam) this is version 2 ps why do you not offer Lingua 'English' in the drop down above - come on we are in 2020...
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 versin 3 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 3
  [Domande d'esame] Final exam Module 3 Dilena version 4 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 4
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena: Module3 version 4 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 4
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 version 5 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 5
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 version 6 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 6
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 version 7 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 7
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 version 8 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 8
  [Domande d'esame] Final exam Di Lena. Module 3 version 9 - 2020 - (pillola free)
  Exam questions Final exam Di Lena. We had 9 different sessions thus 9 different sets of questions (due to the Covid - online exam) this is version 9
  [Appunti] Programmazione per bioinformatica - 2020 - (pillola free)
  This document delves into computational bioinformatics, covering DNA file formats (ASN, FASTA, Genbank), compression, and Python-based decoding. It introduces Principal Component Analysis (PCA) for dimensionality reduction, essential for comparing genomes via codon frequencies. Sequence alignment challenges like indels are discussed. Protein analysis includes BLOSUM50 matrices and information entropy. Advanced techniques like RNA-Seq, ChIP-Seq, and Whole-Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) are explained for studying gene expression, protein-DNA interactions, and epigenetics. A glossary defines core terms such as Next-Generation Sequencing (NGS), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), and Genome-Wide Association Studies (GWAS), underscoring their role in modern genomic research.
• [P530917784] LABORATORY OF BIOINFORMATICS 2 [cod. 66573] (2° anno)
• [P694034973] SYSTEMS AND IN SILICO BIOLOGY [cod. 66576] (2° anno)
• [B5782] ALGORITHMS AND DATA STRUCTURES FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY (2025/2026° anno)
• [B5784] APPLIED GENOMICS (2025/2026° anno)
• [B5779] APPLIED MACHINE LEARNING (2025/2026° anno)
• [B5799] APPLIED MACHINE LEARNING-ADVANCED (2025/2026° anno)
• [B5803] APPLIED MACHINE LEARNING-BASIC (2025/2026° anno)
• [B7295] Advanced Functional Genetics in Model Organisms - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [93272] Advanced Immunology (2025/2026° anno)
• [90921] Advanced Techniques for the Study of Metabolism In Vivo (2025/2026° anno)
• [B5785] BIOANALYTICAL PROTEOMICS AND INTERACTOMICS (2025/2026° anno)
• [B5804] BIOINFORMATICS FOR SYSTEM AND SYNTHETIC BIOLOGY (2025/2026° anno)
• [B5786] BIOMEDICAL DATA BASES (2025/2026° anno)
• [96046] Biophysical Methods for Protein Science (I.C.) (2025/2026° anno)
• [B5780] COMPUTATIONAL METHODS FOR BIOINFORMATICS (2025/2026° anno)
• [96040] Cancer Biology (I.C.) (2025/2026° anno)
• [96047] Crystallography and Cryo-Election Microscopy for Protein Structure Determination (2025/2026° anno)
• [B5787] DNA/RNA DYNAMICS Prerequisite: attendance of the course "Applied Genomics" (2025/2026° anno)
• [B5806] ELEMENTS OF COMPUTATIONAL BIOLOGY (2025/2026° anno)
• [68469] Elements of Biophysics (2025/2026° anno)
• [96043] Genetics and Epigentics of Cancer (2025/2026° anno)
• [70385] Genomics-Based Strategies in the Discovery of Novel Drug Targets Summer School in June (2025/2026° anno)
• [B5788] INTRODUCTION TO BIG DATA PROCESSING INFRASTRUCTURES (2025/2026° anno)
• [84551] Internship Abroad for preparation of the Final Examination - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [84549] Internship for preparation for the Final Examination - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [B5789] LABORATORY OF BIOINFORMATICS 1 (2025/2026° anno)
• [B5795] LABORATORY OF BIOINFORMATICS 2 - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite: attendance of the course "Laboratory of Bioinformatics 1" (2025/2026° anno)
• [91160] Livestock Genomics (2025/2026° anno)
• [B7012] METABOLOMICS TECHNIQUES AND THEIR APPLICATIONS IN PLANT SCIENCE (2025/2026° anno)
• [B5791] MOLECULAR PHYLOGENETICS (2025/2026° anno)
• [66159] Medical Genomics (2025/2026° anno)
• [96042] Metabolic Reprogramming of Cancer Cells (2025/2026° anno)
• [96044] Methologies for the Study And Diagnosis of Cancer (2025/2026° anno)
• [B5808] NEUROSCIENCES (2025/2026° anno)
• [91161] Networks, Security And Data Bases (2025/2026° anno)
• [90923] Neurobiotechnology (2025/2026° anno)
• [B9347] PREREQUISITI PER LA DISCUSSIONE DELLA TESI - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [29595] Pharmacogenomics (2025/2026° anno)
• [86297] Preparation for the Final Examination - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [84548] Preparation for the Final Examination Abroad - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [B9704] STEM CELLS AND REGENERATIVE MEDICINE (2025/2026° anno)
• [B5797] SYSTEMS AND IN SILICO BIOLOGY - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite: attendance of the course "Laboratory of Bioinformatics 1" (2025/2026° anno)
• [96049] Spectroscopic Methods for the Functional and Structural Characterization of Proteins (2025/2026° anno)
• [90920] Stem Cells and 3D Organoid Systems (2025/2026° anno)
• [98159] Viral Genetics (2025/2026° anno)
• [89775] final Examination (14 cfu) - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)
• [89776] final Examination (29 cfu) - Not available for the year 2025/2026 (2025/2026° anno)

 

Sbocchi lavorativi
Analisti e progettisti di software - (2.1.1.4.1)
Biologi e professioni assimilate - (2.3.1.1.1)
Biochimici - (2.3.1.1.2)
Biofisici - (2.3.1.1.3)