I virus sono parassiti endocellulari obbligati, entità molecolari a metà strada tra viventi e non viventi, riproducibili solo in organismi ospiti.
Non hanno struttura cellulare e presentano materiale genetico (DNA o RNA) ma senza attività metabolica propria, evolvendosi tramite variazione genetica.
Le ipotesi sull'origine includono l'evoluzione da elementi genetici autonomi (progressiva), la degenerazione di parassiti intracellulari (regressiva) o l'evoluzione parallela da molecole di RNA auto-replicanti (indipendente).
La struttura virale comprende un capside proteico e materiale genetico (DNA o RNA, singolo/doppio filamento, lineare/circolare), e a volte un pericapside lipidico derivato dalla cellula ospite.
La classificazione avviene per spettro d'ospite (batteri, piante, animali), forma (icosaedrica, elicoidale, complessa) e tipo di acido nucleico (la più usata).
I batteriofagi possono seguire un ciclo litico (replicazione e lisi cellulare) o lisogeno (integrazione del genoma virale come profago, che può poi indurre il ciclo litico o causare conversione lisogenica).
I virus animali (spesso a RNA) entrano per endocitosi o fusione, realizzando cicli litici o lisogeni (come provirus). I virus a RNA mutano più rapidamente a causa dell'assenza di proofreading nella RNA polimerasi.
I virus a RNA (+) possono fungere direttamente da mRNA, mentre quelli a RNA (-) devono portare una RNA polimerasi RNA-dipendente.
I retrovirus (es. HIV), virus a RNA (+), sono peculiari perché replicano il loro genoma passando attraverso un intermedio a DNA, usando la trascrittasi inversa per integrare il DNA virale nel genoma ospite.
Agli agenti infettivi subvirali appartengono i viroidi (RNA circolare nudo, patogeni vegetali) e i prioni (proteine infettive che causano malattie neurodegenerative alterando la conformazione di proteine sane).
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