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first lessons of metagenomics
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Di cosa parla
- Metagenomica è l'analisi sull'espressione genetica di tutta la comunità microbica in un campione, utilizzando il sequencing a scoppio (shotgun metagenomics) o solo dei marker geni.
- L'approccio del metagenoma include l'estrazione del DNA, la preparazione della libreria per il sequenziamento di nuova generazione e l'analisi bioinformatica per interpretare i dati.
- Le caratteristiche chiave dei campioni metagenomici includono variabili come l'età, il peso, la temperatura e il pH, che influenzano lo stato del microbioma.
- L'16S rDNA è un marker gene per la filogenesi batterica, con regioni conservate utilizzate per identificare le specie e regioni ipervariabili per l'analisi specifica della specie.
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