genomics

Materie del corso

BIOETHICS [cod. 85284] cod. P740165024 · 1° anno · 0 file

CALCULUS [cod. 75376] cod. P837175264 · 1° anno · 0 file

CHEMISTRY [cod. 87617] cod. P531176256 · 1° anno · 6 file

Appunti Appunti lezione di chemistry — 2021 pillola free Esplora i fondamenti della reattività chimica e delle formule, dalla classificazione dei composti (ossidi, idruri, acidi) alle formule empiriche e strutturali. Approfondisci la natura dei legami chimici, la formazione di orbitali molecolari, e il ruolo dell'energia nella stabilità. Comprendi la teoria del legame di valenza, l'importanza della sovrapposizione degli orbitali e le geometrie molecolari derivanti dall'ibridazione (sp, sp2, sp3, dsp3), essenziali per gli studi di chimica e genomica. Riassunti biochemistry — 2022 pillola free biochemistry schemes Appunti eq chimico — 2022 pillola free Un sistema chiuso all'equilibrio a temperatura e pressione costanti ha un rapporto costante tra le concentrazioni molari elevate al proprio coefficiente stechiometrico dei prodotti e reagenti. L'equilibrio chimico può essere irreversibile o reversibile, con valori di Keq che indicano la direzione in cui procede la reazione. La temperatura influisce sul valore di Keq per reazioni endotermiche (aumento di temperatura aumenta Keq) e esotermiche (aumento di temperatura diminuisce Keq). Le variazioni di concentrazione o pressione possono spostare l'equilibrio secondo il principio di Le Chatelier. Appunti thermodynamics — 2022 pillola free notes Appunti acids and bases — 2022 pillola free Il concetto di acido e base è evoluto nel tempo: Boyle (1660) descrive le proprietà, Lavoisier (1787) ipotizza composizione acidi, Davy (1811) identifica H come elemento in acido, Arrhenius (1887) introduce teoria degli ioni H+ e OH-, Bronsted e Lowry (1922) definiscono acido come donatore di protone, base come accettore. Acidi monoprotici liberano un solo H+, basi formano OH-. Teoria Arrhenius spiega proprietà macroscopiche, teoria Bronsted-Lowry estende a reazioni in fase gassosa. Autoionizzazione dell'acqua produce H3O+ e OH-, Kw = 10^-14. pH misura acidità, pOH basicità. Acidi forti si ionizzano completamente, deboli parzialmente; basi analogamente Appunti velocità di reazione — 2022 pillola free Cinetica chimica riguarda la velocità di reazione, misurata dalla variazione della concentrazione dei reagenti o prodotti nel tempo. Le reazioni in fase gassosa o soluzionale si misurano con concentrazioni. L'equazione cinetica descrive come la velocità varia con la concentrazione dei reagenti, determinando l'ordine di reazione (0°, 1°, 2°). La teoria degli urti spiega che maggiore è la concentrazione e la temperatura, più probabile è la reazione. L'Ea rappresenta l'energia minima per iniziare una reazione. Il meccanismo di reazione include stadi elementari con Ea differenti; lo stadio limitante determina la velocità complessiva. I catalizzatori, omoge

GENETICS [cod. 87615] cod. P953891533 · 1° anno · 3 file

Appunti Appunti genetics — 2021 pillola free This genomics course explores core GENETICS principles, from advanced DNA sequencing and human genome composition (coding/non-coding sequences, epigenomic marks) to Mendelian inheritance. Learn about Mendel's laws, how probability applies to genetic crosses (SUM/PRODUCT rules, conditional probability), and statistical hypothesis testing using the Chi-square test (p-value, degrees of freedom). The material also covers the discovery of chromosomes, the chromosomal theory of inheritance, and fundamental cell division processes: binary fission in prokaryotes, and detailed mitosis and meiosis in eukaryotes, highlighting chromosome structure (homologs, sister chromatids), number (haploid/diploid), and the cell cycle. Essential for understanding gene transmission and variation. Riassunti Genetics — 2021 pillola free Riassunti di Genetics dal libro di testo Riassunti mutations — 2021 pillola free Variante genetica e mutazione: fonte di varietà genetica e variabilità fenotipica, fondamentale per l'adattamento ambientale e l'evoluzione. Mutazioni possono causare malattie ma sono anche strumenti chiave nell'analisi genetica. Varietà genetica può essere da un singolo baso a una cromosoma intero. Errore nella riproduzione del DNA, spesso corretto, ma può portare a mutazioni puntuali o di breve variazione genetica. Mutazioni importanti come la perdita di funzione possono influenzare il fenotipo in modo dominante o recessivo. Varietà numerica e strutturale dei cromosomi contribuisce alla variabilità genetica individuale, con conseguenze per l'evoluzio

LINEAR ALGEBRA [cod. 91157] cod. P441805171 · 1° anno · 0 file

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL [cod. 87614] cod. P378863841 · 1° anno · 4 file

Riassunti MBC2 — 2022 Il ciclo cellulare è regolato da fasi G1, S, G2 e M, controllate da complessi Cyclin-Cdk. Questi complessi governano la progressione del ciclo attraverso fasi di fasi preparatorie e attive. La CAK fosforyla i Cdk per attivarli, mentre Wee1 li inibisce prima della mitosi. Cdc25 rimuove l'inibizione sui Cdk. Complessi come APC/C regolano la separazione dei cromatidi durante la mitosi. CiclinD e G1-S governano le fasi iniziali, mentre S-Cyclin e M-Cyclin attivano rispettivamente la replicazione del DNA e la mitosi. La proteasi Cdk è controllata da ciclini e fosfoproteasi come Cdc20 e Cdh1. Il sistema di controllo cellulare funziona come una rete di switch Riassunti MBC1 — 2022 pillola free Prokaryotic cells specialize, with some performing photosynthesis, socializing for nitrogen fixation, or developing into resistant forms. Eukaryotic cells have compartmentalization, including nuclei, organelles like mitochondria and chloroplasts (with their own DNA), and cytoskeleton. Nucleic acids store genetic info in nucleotides; DNA has a double helix with specific base pairing. Supercoiling influences DNA shape and compaction. Eukaryotic chromatin is organized into nucleosomes, forming fibers and chromosomes with histone modifications regulating access and transcription. Heterochromatin is less accessible, while euchromatin is more active. The nuc Riassunti MBC3 — 2022 pillola free Forcelli molecolari sui cromosomi alla polo del filamento: APC/C triga la separazione delle cromatidi sorelle e della meiosi. Mad2 controlla se i cromatidi sono attaccati correttamente. Transrizione divisa in inizio, prolungamento e fine; richiede promotori, terminatori e fattori di riconoscimento. Polimerasi RNA complessi multiunitari, diversi nei eukaryoti e prokaryoti. Sigma factori guida la polimerasi verso i promotori. Promotore vegetativo ha elementi -10 e -35 con sequenze consensuistiche; deviazioni influenzano l'efficienza della transrizione. Regolazione post-traduzionale dei sigma factori tramite pro- e anti-sigma factori. Domande d'esame MBC4 — 2022 pillola free RNA processing in eukaryotes involves cleavage, splicing, 5' capping, and polyadenylation to generate mature RNA. Alternative splicing creates diverse mRNA isoforms. RNA modifications like editing and base changes provide regulation and quality control. Ribosomal and tRNA precursors are processed by ribonucleases, with RNase III playing a key role. CCA addition and nucleotide modifications enhance functionality. Eukaryotic mRNAs are capped at 5' and polyadenylated at 3'. Translation decodes mRNA into proteins using tRNAs and ribosomes, with proofreading ensuring accuracy.

PHYSICS [cod. 85289] cod. P970501119 · 1° anno · 0 file

PROGRAMMING [cod. 85285] cod. P096460166 · 1° anno · 0 file

ALGORITHMS AND DATA STRUCTURES IN BIOLOGY [cod. 85301] cod. P814123962 · 2° anno · 1 file

Appunti Algorithms and data structures in biology (2020/2021) — 2021 pillola free APPUNTI a mano Algorithms and data structures in biology (2020/2021)

BIOINFORMATICS [cod. 85297] cod. P297257460 · 2° anno · 0 file

EPIGENOMICS [cod. 85299] cod. P789387455 · 2° anno · 0 file

EUKARYOTIC GENOMES [cod. 85293] cod. P443955051 · 2° anno · 3 file

Appunti lezione 2 — 2019 EUKARYOTIC RNA POLYMERASE II sintetizza mRNA, richiamando fattori di trasrizione per leggere i promotori. I promotori CpG contengono isole ricche di C e G, mentre quelli del tipo II hanno box TATA e Initiator. Le isole CpG sono comuni nei geni housekeeping, mentre i promotori con TATA box in genes tisssue-specifici. La sintesi RNA avviene 5'→3', con nucleofilo l'OH gruppo 3' del polimero. Riassunti eukaryotic genomes 1 — 2023 pillola free Il testo sembra contenere simboli e caratteri non leggibili. Non è possibile estrarre un riassunto significativo dal materiale fornito. Assicurati di caricare il testo chiaro e comprensibile per poterlo riassumere correttamente. Riassunti eukaryotic genomes 2 — 2023 pillola free Il sistema two-hybrid permette di studiare interazioni proteica-proteica utilizzando fattori di trasduzione: il dominio di legame DNA (bait) e il dominio attivante (prey). Se le proteine interagiscono, i due domini possono legare la regione promotoria per trascrivere il gene; altrimenti non accade. Il sistema GAL4/UAS utilizza GAL4 per legare alle sequenze UAS e attivare l'espressione del gene. Questo ha portato alla deteczione di 957 interazioni coinvolgendo 1004 proteine di S. cerevisiae, rivelando interazioni che mettono in contesto funzionale proteine non classificate e legano funzioni biologiche insieme.

INTRODUCTORY STATISTICS [cod. 85290] cod. P635559188 · 2° anno · 1 file

Appunti introductory statistics appunti — 2021 pillola free This document introduces fundamental concepts of statistics, defining it as the art of learning from data essential for scientific and economic understanding. It differentiates between deterministic phenomena, which follow predictable mathematical laws, and random phenomena, which are inherently uncertain. The text explores chaotic systems, deterministic yet unpredictable due to sensitive dependence on initial conditions (the "butterfly effect"), noting the difficulty in distinguishing chaos from true randomness. It outlines a five-step process for data analysis: collection, description, analysis, diagnostics, interpretation, and conclusion drawing. Key terms in descriptive statistics are defined, including statistical unit, variable (represented by X, Y), observed sample (x1, y1), and sample size (n).

METABOLOMICS [cod. 85295] cod. P618615835 · 2° anno · 1 file

Riassunti Metabolomics — 2023 Glycolisi regolata da vari fattori come glucosio, AMP e ATP. Hexokinasa è attivata da glucosio e AMP, inhibita da frutoso 6-fosfato. Glucogenesi inversa di glycolisi, regolata da citrato che inibisce frutoso 1,6-bisfosfatasi. Regolazione di PFK-1 e pyruvato kinase influenzate da livelli di energia cellulari. Ciclo di Cori: pyruvato convertito in alanina nel muscolo, trasportata al fegato per gluconeogenesi. Fermentazione lattica e etanica producono NAD+ e ethanol rispettivamente. Citrato cicle avviene nelle mitocondrie con conversione di pyruvato a acetaolo e poi a etilene glicol.

METAGENOMICS [cod. 85300] cod. P519589661 · 2° anno · 1 file

Appunti first lessons of metagenomics — 2023 pillola free Metagenomica è l'analisi del genoma di comunità microbiche attraverso la sequenza indiretta di materiali geneticici presenti in campioni. L'approccio tradizionale con il Sanger era costoso e limitato, mentre oggi si utilizzano tecnologie Next Generation Sequencing per analizzare migliaia di campioni. Il metagenoma include i genomi di tutte le specie nel microbioma, mentre la metagenomica implica la sequenza randomizzata di questi genomi. L'approccio con gene marker come l'16S rDNA è più veloce ma meno dettagliato. Le studi metagenomici comparano campioni di malattia e salute per identificare associazioni e determinanti del microbioma, utilizzando tecni

PROKARYOTIC GENOMES [cod. 85292] cod. P170637975 · 2° anno · 1 file

Riassunti prokaryotic genomes Cappelletti — 2022 pillola free Primi e secondi generi di sequenziamento: - Sanger: tecnica laboriosa e costosa, con fragmentazione del DNA, lacciatura degli adattatori, PCR o bridge amplificazione, imageria e analisi dei dati. - Illumina: sequenziamento da sinistra a destra, cluster formati su supporto di vetro, PCR per replicare i fragmenti, sequenziamento in parallelo con dNTPs fluorescenti. - Roche 454: sequenziamento pyrosequenziale, fragmentazione del DNA, lacciatura degli adattatori, amplificazione e sequenziamento su nanopori. Terzo genero: - PacBio: sequenziamento in tempo reale di molecole singole senza PCR, utilizzo di SMRTbell template, incorporamento dinucleotide per tr

SOFTWARE APPLICATIONS [cod. 85296] cod. P018068718 · 2° anno · 0 file

3D GENOMICS (I.C.) - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite: Chemistry and Genomes I cod. B5846 · 2025/2026° anno · 0 file

APPROFONDIMENTO IN LINGUA ITALIANA DI METODOLOGIE E TEMATICHE LEGATE ALLA GENOMICA - Not available for the year 2025/2026 cod. B9224 · 2025/2026° anno · 0 file

Advanced Programming - Not available for the year 2025/2026 cod. 93363 · 2025/2026° anno · 0 file

Algorithms and Data Structures in Biology - Not available for the year 2025/2026 cod. 85301 · 2025/2026° anno · 0 file

Bioinformatics - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite Programming cod. 85297 · 2025/2026° anno · 0 file

Biological Informational Molecules (I.C.) cod. 87613 · 2025/2026° anno · 0 file

Calculus cod. 75376 · 2025/2026° anno · 0 file

Chemistry cod. 87617 · 2025/2026° anno · 0 file

Data Science - Not available for the year 2025/2026 Prerequisiste Introductory Statistics cod. 85302 · 2025/2026° anno · 0 file

ELECTIVE INTERNSHIP - Not available for the year 2025/2026 cod. B4122 · 2025/2026° anno · 0 file

ETHICS, LAW AND AI - Not available for the year 2025/2026 cod. 99472 · 2025/2026° anno · 0 file

Elective Internship Abroad - Not available for the year 2025/2026 cod. B4123 · 2025/2026° anno · 0 file

Epigenomics cod. 85299 · 2025/2026° anno · 0 file

Eukaryotic Genomes cod. 99475 · 2025/2026° anno · 0 file

Final Exam - Not available for the year 2025/2026 cod. 75760 · 2025/2026° anno · 0 file

Genetics cod. 87615 · 2025/2026° anno · 0 file

Genomes I (I.C.) - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite Biological Informational Moleculess cod. 99473 · 2025/2026° anno · 0 file

Genomes II (I.C.) - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite Genomes I (I. C.) cod. 85298 · 2025/2026° anno · 0 file

Genomics and Complex Traits - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite Biological Informational Molecules cod. 85307 · 2025/2026° anno · 0 file

Internship - Not available for the year 2025/2026 cod. 85201 · 2025/2026° anno · 0 file

Internship Abroad - Not available for the year 2025/2026 cod. 85319 · 2025/2026° anno · 0 file

Introductory Statistics cod. 93264 · 2025/2026° anno · 0 file

Linear Algebra cod. 91157 · 2025/2026° anno · 0 file

Livestock Genomics - Not available for the year 2025/2026 cod. 91160 · 2025/2026° anno · 0 file

MOLECULAR MODELING AND SIMULATION cod. B5847 · 2025/2026° anno · 0 file

Mathematics (I.C.) cod. 85283 · 2025/2026° anno · 0 file

Medical Genomics - Not available for the year 2025/2026 cod. 66159 · 2025/2026° anno · 0 file

Metagenomics cod. 85300 · 2025/2026° anno · 0 file

Molecular Biology of the Cell cod. 87614 · 2025/2026° anno · 0 file

Molecular and Genome Evolution - Not available for the year 2025/2026 cod. 93266 · 2025/2026° anno · 0 file

Networks, Security And Data Bases - Not available for the year 2025/2026 cod. 91161 · 2025/2026° anno · 0 file

PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY AND METABOLOMICS - Not available for the year 2025/2026 cod. B9223 · 2025/2026° anno · 0 file

Pharmacogenomics - Not available for the year 2025/2026 cod. 29595 · 2025/2026° anno · 0 file

Physics cod. 99477 · 2025/2026° anno · 0 file

Plant Functional Genomics - Not available for the year 2025/2026 cod. 91158 · 2025/2026° anno · 0 file

Programming cod. 85285 · 2025/2026° anno · 0 file

Prokaryotic Genomes cod. 99474 · 2025/2026° anno · 0 file

Proteomes, Interactomes and Biological Networks - Not available for the year 2025/2026 Prerequisite Metabolomics and Genomes II cod. 85306 · 2025/2026° anno · 0 file

Statistical Methods for Genomics - Not available for the year 2025/2026 prerequisite Introductory Statistics cod. 95065 · 2025/2026° anno · 0 file

Stem Cells - Not available for the year 2025/2026 cod. B2195 · 2025/2026° anno · 0 file

Structural Biology cod. 85304 · 2025/2026° anno · 0 file

Systems and Synthetic Microbiology - Not available for the year 2025/2026 cod. 91159 · 2025/2026° anno · 0 file

Viral Genetics - Not available for the year 2025/2026 cod. 98159 · 2025/2026° anno · 0 file

DATA SCIENCE [cod. 85302] cod. P689088008 · 3° anno · 0 file

GENOMICS AND COMPLEX TRAITS [cod. 85307] cod. P875213225 · 3° anno · 0 file

MULTISCALE MODELING [cod. 85305] cod. P349402849 · 3° anno · 0 file

PROTEOMES, INTERACTOMES AND BIOLOGICAL NETWORKS [cod. 85306] cod. P144686247 · 3° anno · 0 file

STATISTICAL METHODS FOR GENOMICS [cod. 85308] cod. P796508127 · 3° anno · 0 file

STRUCTURAL BIOLOGY [cod. 85304] cod. P673610840 · 3° anno · 0 file