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Microbiologia industriale (Uccelletti 2021)

Università degli Studi di Roma - La Sapienza biotecnologie 2021
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Le biotecnologie industriali (bianche) sfruttano microrganismi per produrre beni commerciali. La loro classificazione basata su habitat (temperatura, pH, salinità, pressione) e metodi filogenetici (PCR, rRNA 16S, ITS) è fondamentale. La metagenomica, con librerie sequence/function driven e tecniche di arricchimento (BrdU, SIP, SIGEX), rivela la biodiversità microbica. Gli Archea estremofili (alofili, metanogeni, acidofili, ipertermofili) offrono soluzioni per estremoliti, biometano e bioreattori salini. Le bioplastiche (PHA) sono prodotte battericamente usando scarti come crusca o oli esausti. I biosensori batterici (Ames, Light-on/off, FISH), a lieviti (GPCR, AChE, metalli pesanti) e a C. Elegans rilevano tossicità, inquinanti o gravidanza. I lieviti, come S. Cerevisiae, sono cruciali in panificazione, birrificazione e come probiotici grazie alle loro capacità metaboliche e riproduttive.
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  • Biotecnologie Industriali (Bianche): Sfruttano microrganismi per produzione commerciale, ottimizzazione processi e innovazione.
  • Caratterizzazione e Biodiversità Microbica:
    • Classificazione: Per habitat (temperatura, pH, salinità, pressione) e filogenetica (PCR, rRNA 16S, ITS).
    • Tecniche Molecolari: PCR, RAPD, RFLP, DGGE per variabilità genetica; Conta fluorescenza, FISH per identificazione.
    • Approcci alla Biodiversità: Coltura-dipendente (arricchimento) e Metagenomica (studio diretto genomi, usando RCA).
      • Librerie Metagenomiche: Function-driven (esprime caratteristiche) o Sequence-driven (identifica enzimi).
      • Strategie di Arricchiamento: BrdU, SIP, SIGEX per cloni specifici.
  • Archea e Applicazioni Industriali:
    • Alofili: Vivono in alte concentrazioni saline. Producono estremoliti (es. ectoina, PGA) per protezione o sono usati come ospiti per molecole ricombinanti (es. levano), eliminando la sterilizzazione.
    • Metanogeni: Anaerobi che producono metano. Utilizzati per biometano da scarti (melasse, cellulosa) in consorzi microbici.
    • Acidofili Estremi e Ipertermofili: Adattati a condizioni estreme di pH e temperatura.
  • Bioplastiche (PHA): Polimeri biodegradabili da batteri. Prodotte da scarti come crusca (con pretrattamenti) o oli esausti (con alofili).
  • Biosensori: Sistemi che rilevano analiti (biodisponibilità, tossicità, genotossicità) tramite un'unità biologica e un trasduttore.
    • Batterici: Test di Ames (genotossicità), Light-Off/On (tossicità), sistemi combinati, array.
    • A Lieviti: Economici e robusti. Usati per test di gravidanza (GPCR), rilevamento contaminanti (inibitori AchE), recupero metalli pesanti (es. lantanio con proteine chimeriche).
    • A C. Elegans: Modello per misurare tossicità (es. bisfenoli) tramite Comet assay, apoptosi, stress ossidativo.
  • Lieviti (incluso Saccharomyces Cerevisiae):
    • Caratteristiche: Unicellulari, parete cellulare, riproduzione per gemmazione/scissione, metabolismo fermentativo/respiratorio (effetti Pasteur, Crabtree).
    • Applicazioni Industriali:
      • Panificazione: Produzione di CO2.
      • Birra: Produzione di etanolo (Lager, Ale), con specifiche materie prime (malto, luppolo) e fasi di processo.
      • Probiotici: Saccharomyces boulardii per le sue proprietà benefiche (crescita in ambienti difficili, biofilm, resistenza antibiotica cromosomale).

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