Riassunti VERIFICATO
prokaryotic genomes Cappelletti
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Di cosa parla
- Sequencing tecniques: Sanger e seconda generazione (Illumina, Roche 454), terza generazione (PacBio, Oxford Nanopore)
- Sanger sequencing: utilizza ddNTPs con marcatori radioattivi per determinare la sequenza DNA, poi convertito in formato FASTA e analizzato con BLAST
- Seconda generazione Illumina: fragmentazione DNA, laccaggio adattori, PCR emulsionale, sequenziamento mediante incorporamento di base e rilascio di luce (pyrosequencing), analisi da immagini CCD
- PacBio SMRT: sequenziamento in tempo reale senza amplificazione, utilizzo di ZMW per dettare incorporamento nucleotide e generazione di subreads, produzione di reads lunghi con alta precisione
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