Il corso ha lo scopo di illustrare la complessità strutturale e funzionale delle cellule e delle modalità grazie alle quali le cellule modulano ed integrano l’attività delle diverse componenti cellulari sia costitutive…
Scheda dell'insegnamento
Obiettivi formativi
Il corso ha lo scopo di illustrare la complessità strutturale e funzionale delle cellule e delle modalità
grazie alle quali le cellule modulano ed integrano l’attività delle diverse componenti cellulari sia
costitutive che in risposta a stimoli esterni. Il corso descrive la dinamicità dell’attività dei principali
organelli cellulari e della relazione tra essi, gli elementi del citoscheletro e tutte le componenti
citoplasmatiche. Nel complesso il corso fornirà le conoscenze necessarie per la comprensione
delle diverse attività cellulari, condizione necessaria per il successivo studio delle patologie
associate alla loro alterazione.
Conoscenza e capacita' di comprensione: Si riferisce alle conoscenze disciplinari e descrive come e a quale livello lo studente debba essere
in grado di rielaborare in maniera personale quanto appreso per trasformare le nozioni in
riflessioni più complesse e in parte originali. Lo studente deve conoscere il linguaggio della
disciplina sia teorico che pratico. Lo studente deve avere piena conoscenza e comprensione delle
basi del funzionamento e comunicazione trai diversi compartimenti cellulari e dei meccanismi che
sottendono al loro funzionamento. Lo studente avrà le basi conoscitive necessarie a comprendere
i meccanismi dell’organizzazione sociale delle cellule nei tessuti in cui risiedono e delle basi della
comunicazione cellulare e del ruolo di quest’ultima nell’omeostasi delle singole cellule, dei tessuti
e dell’intero organismo
Capacita' di applicare conoscenza e comprensione: L’obiettivo generale del corso èdi offrire agli studenti la capacità di costruirsi un quadro
concettuale e realistico della cellula che consenta loro di valutare criticamente nuovi concetti
scientifici e, soprattutto, di capirli.
Programma
Il corso è suddiviso in tre parti ognuna delle quali suddivisa in aree tematiche.
CORSO DI BIOLOGIA CELLULARE (Parte I)
AREA TEMATICA 1: CHIMICA DEGLI ORGANISMI VIVENTI, PROTEINE, ENZIMI 1.
COMPOSIZIONE CHIMICA DEGLI ORGANISMI VIVENTI, LEGAMI CHIMICI, RUOLO
DEL’ACQUA, IMPORTANZA DEI LEGAMI DEBOLI 2. AMMINOACIDI, LEGAME PEPTIDICO,
CARATTERISTICHE DELLE CATENE POLIPEPTIDICHE 3. STRUTTURA DELLE PROTEINE 4.
PRINCIPI DELL’ENERGETICA DELLE CELLULE, ENZIMI, ENERGIA DI ATTIVAZIONE
AREA TEMATICA 2: STRUTTURA DEL DNA, CROMATINA/CROMOSOMI, REPLICAZIONE
DEL DNA 1. STRUTTURA DEI NUCLEOTIDI E DELLA DOPPIA ELICA DI DNA 2. NUCLEOSOMI
E ORGANIZZAZIONE DELLA CROMATINA 3. CROMOSOMI, CARIOTIPO, BANDEGGIATURA
DEI CROMOSOMI 4. GLI ENZIMI E IL MECCANISMO MOLECOLARE DELLA REPLICAZIONE
DEL DNA 5. LA PRECISIONE DELLA REPLICAZIONE DEL DNA 6. INIZIO DELLA
REPLICAZIONE, REPLICONI, RIFORMAZIONE DEI NUCLEOSOMI, TELOMERI E
TELOMERASI
AREA TEMATICA 3: RNA, TRASCRIZIONE 1.STRUTTURA E FUNZIONE DELLE DIFERENTI
CLASSI DI RNA DI UNA CELLULA EUCARIOTICA 2. TRASCRIZIONE IN PROCARIOTI: RNA
POLIMERASI BATTERICA, PROMOTORI, INZIO, ELONGAZIONE E TERMINAZIONE 3.
TRASCRIZIONE IN EUCARIOTI: RNA POLIMERASI EUCARIOTICHE, FATTORI DI
TRASCRIZIONE, INIZIO, ELONGAZIONE E TERMINAZIONE DELLA TRASCRIZIONE 4.
MATURAZIONE DEGLI mRNA IN EUCARIOTI (CAPPING, SPLICING, POLIADENILAZIONE) 5.
SCHEMA GENERALE DELL’ORGANIZZAZIONE DEL GENOMA UMANO 6. TRASCRIZIONE
DEGLI rRNA E FORMAZIONE DEI RIBOSOMI
AREA TEMATICA 4: TRADUZIONE 1. IL CODICE GENETICO 2. STRUTTURA DEI tRNA,
APPAIAMENTO CODONE/ANTICODONE 3. ATTIVAZIONE DEGLI AMMINOACIDI,
AMMINOACIL-tRNA SINTETASI 4. STRUTTURA E FUNZIONE DEI RIBOSOMI 5. INIZIO DELLA
TRADUZIONE IN PROCARIOTI ED EUCARIOTI; FUNZIONE DEI PRINCIPALI FATTORI
D’INIZIO PROCARIOTICI ED EUCARIOTICI 6. ELONGAZIONE E TERMINE DELLA
TRADUZIONE; FUNZIONE DEI PRINCIPALI FATTORI D’ELONGAZIONE PROCARIOTICI ED
EUCARIOTICI 7. CONTROLLO DELLA FEDELTA’ DELLA TRADUZIONE 8. I POLIRIBOSOMI
AREA TEMATICA 5: FOLDING 1. PRINCIPI GENERALI DEL FOLDING DI UNA PROTEINA,
L’ESPERIMENTO DI ANFINSEN 2. IL FOLDING NELLE CELLULE, DEFINIZIONE E FUNZIONE
DEGLI CHAPERONEs 3. DEGRADAZIONE DELLE PROTEINE: UBIQUITINA E PROTEASOMA
4. LE UBIQUITINO-LIGASI: POLIUBIQUITINAZIONE E SEGNALI DI DEGRADAZIONE SULE
PROTEINE 5. AGGREGATI PROTEICI: FILAMENTI CROCIATI BETA, PRIONI, MALATTIE
NEURODEGENERATIVE
CORSO DI BIOLOGIA CELLULARE (Parte II)
AREA TEMATICA 6: MICROSCOPIA E STRUTTURA DELLE MEMBRANE 1. PRINCIPI
GENERALI DELLA MICROSCOPIA OTTICA; LIMITE DI RISOLUZIONE E POTERE
RISOLUTIVO 2. MICROSCOPIA A FLUORESCENZA: TECNICA DEL SANDWICH, UTILIZZO
DELLA GFP 3. SIGNIFICATO DELLA COMPARTIMENTALIZZAZIONE CELLULARE 4.
ORGANIZZAZIONE DELLE MEMBRANE. PRINCIPALI COMPONENTI DI MEMBRANA
5.PROPRIETA’ DINAMICHE DELLA MEMBRANA PLASMATICA, RUOLO DEL COLESTEROLO
E ZATTERE LIPIDICHE 6. OLIGOSACCARIDI E GLICOCALICE.
AREA TEMATICA 7: TRASPORTO DI MEMBRANA 1. SELETTIVITA’ DELLA MEMBRANA E
DEFINIZIONE DI OSMOSI 2. PROTEINE TRASPORTATRICI E PROTEINE CANALE 3. ESEMPI
DI DIFFUSIONE SEMPLICE, TRASPORTO PASSIVO ED ATTIVO 4. GRADIENTE
ELETTROCHIMICO COME FORMA DI ENERGIA PER IL TRASPORTO DI MEMBRANA 5.
MODELLO DI FUNZIONE E SELETTIVITA’ DELLE PROTEINE CANALE. POMPA NA+/K+ 6.
GENERAZIONE DEL POTENZIALE DI MEMBRANA
AREA TEMATICA 8: ORGANIZZAZIONE GENERALE DELLE CELLULE EUCARIOTE;
TRASPORTO BIDIREZIONALE NUCLEO/CITOSOL 1.DIFFERENZE MORFOLOGICHE TRA
PROCARIOTI ED EUCARIOTI. CONCETTO DI MORFOLOGIA DINAMICA DELLE CELLULE
EUCARIOTICHE 2. FORMAZIONE DELLA CELLULA EUCARIOTA E TEORIA
DELL’ENDOSIMBIONTE 3. MOVIMENTO DELLE PROTEINE TRA COMPARTIMENTI E
CONCETTO DI COMPARTIMENTI TOPOLOGICAMENTE EQUIVALENTI 4. SCHEMA
GENERALE DEL TRASPORTO TRA COMPARTIMENTI E SEQUENZE SEGNALE 5.
ORGANIZZAZIONE STRUTTURALE E FUNZIONALE DEL NPC 6. RUOLO DI IMPORTINE ED
ESPORTINE; COMPARTIMENTALIZZAZIONE E RUOLO DI RAN-GTP/RAN-GDP
AREA TEMATICA 9: MITOCONDRI E PEROSSISOMI 1. PRECURSORI DELLE PROTEINE
MITOCONDRIALI, SEGNALE DI IMPORT E RECETTORE (TOM 70, 71 E 20) 2. SCHEMA
GENERALE DELL’IMPORT MITOCONDRIALE (TOM 40, TIM 23) 3. RUOLO DEL
METABOLISMO ENERGETICO NELL’IMPORT MITOCONDRIALE 4. DIVERSE ESIGENZE DI
TRASPORTO E LOCALIZZAZIONE: I COMPLESSI SAM, TIM 22 E LE FUNZIONI DEL
COMPLESSO OXA 5. MORFOLOGIA, DISTRIBUZIONE E DINAMICITA’ DEL NETWORK MITOCONDRIALE. 6.FUNZIONI DEI PEROSSISOMI E TEORIA SULLA BIOGENESI
AREA TEMATICA 10: RETICOLO ENDOPLASMATICO 1. STRUTTURA, FUNZIONI E
LOCALIZZAZIONE DEL ER. METODI DI ISOLAMENTO RER E SER 2. TRASLOCAZIONE
POST- E CO-TRADUZIONALE. TEORIA DEL SEGNALE 3. PARTICELLA SRP: IPOTESI
SULL’ASSEMBLAGGIO, ATTACCO AL RECETTORE, CICLO DEI RIBOSOMI E DELLA SRP 4.
IL TRASLOCATORE E TRASLOCAZIONE DI PROTEINE SOLUBILI E DI MEMBRANA 5. NGLICOSILAZIONE
E CONTROLLO DI QUALITA’ 6.SINTESI DEI LIPIDI DI MEMBRANA
AREA TEMATICA 11: TRAFFICO VESCICOLARE 1.IL TRAFFICO VESCICOLARE NEL SUO
INSIEME, CONCETTO DI TRASPORTO ANTEROGRADO E RETROGRADO 2. RIVESTIMENTI
DELLE VESCICOLE. STRUTTURA E FUNZIONE DELLA CLATRINA 3. RUOLO DELLE
PROTEINE AP-2, DAB2 E DEI FOSFOINOSITIDI. DOMINI BAR E RUOLO DELLA DINAMINA 4.
PROTEINE RAB E SNARE 5. MODELLO DI FUSIONE. “ENTRY” VIRALE
AREA TEMATICA 12: EXPORT DAL RETICOLO. GOLGI E LISOSOMI 1. FORMAZIONE DI
VESCICOLE COPII. COME SI MUOVONO LE VESCICOLE 2. FUSIONE OMOTIPICA E
COMPARTIMENTO INTERMEDIO. SEGNALI DI RITENZIONE NELL’ER 3. STRUTTURA,
FUNZIONE E LOCALIZZAZIONE DELL’APPARATO DEL GOLGI. N- GLICOSILAZIONE ED OGLICOSILAZIONE
4. MODELLI DI TRASPORTO ATTRAVERSO IL GOLGI. RUOLO DELLE
GOLGINE. 5. STRUTTURA FUNZIONE E LOCALIZZAZIONE DEI LISOSOMI. 6. VIE DI
DEGADAZIONE NEI LISOSOMI. SEGNALE DI LOCALIZZAZIONE NEI LISOSOMI MANNOSIO
6-P
AREA TEMATICA 13: ENDOCITOSI ED ESOCITOSI 1. MATURAZIONE DEGLI ENDOSOMI.
COMPLESSI ESCRT 2. VESCICOLE RICOPERTE DI CLATRINA E CAVEOLINA. 3.
MACROPINOCITOSI E FAGOCITOSI. UTILIZZO DELLE VIE ENDOCITICHE DA PARTE DI
PATOGENI 4. ESEMPI DI ENDOCITOSI MEDIATA DA RECETTORE 5. ESOCITOSI: VIA
COSTITUTIVA E REGOLATA, MATURAZIONE DEI GRANULI, ESOCITOSI DI VESCICOLE
SINAPTICHE
AREA TEMATICA 14: IL CITOSCHELETRO 1. CARATTERISTICHE E FUNZIONI GENERALI.
LOCALIZZAZIONE DEI DIVERSI ELEMENTI DEL CITOSCHELETRO 2. ASSEMBLAGGIO E
CONCETTO DI DIMAMICITA DEL CITOSCHELETRO 3. NUCLEAZIONE, CONCENTRAZIONE
CRITICA E TRANDMILLING, RUOLO DI TIMOSINA E PROFILINA 4. LE PRINCIPALI PROTEINE
CHE LEGANO E REGOLANO LA DINAMICITA’ DEL CITOSCHELETRO 5. STRUTTURA E
FUNZIONI DEI MOTORI PROTEICI 6. I FILAMENTI INTERMEDI 7. RUOLO DELLE PROTEINE
KASH E SUN
CORSO DI BIOLOGIA CELLULARE (Parte III)
AREA TEMATICA 15: SEGNALAZIONE 1. PRINCIPI GENERALI DELLA SEGNALAZIONE
CELLULARE 2. RUOLO DELLE PROTEINE G ETEROTRIMERICHE 3. RUOLO DEI RECETTORI
TIROSINA KINASI 4. PRINCIPALI SECONDI MESSAGGERI (cAMP, Ca2+, IP3) 5. RECETTORI
ACCOPPIATI A CANALI IONICI 6. MODALITA DI PROPAGAZIONE DELL’IMPULSO IN
CELLULE MUSCOLARI
AREA TEMATICA 16: GIUNZIONI CELLULARI 1. PRINCIPALI CARATTERISTICHE E
COMPONENTI DELLE GIUNZIONI CELLULARI 2. STRUTTURA E FUNZIONE DELLE
GIUNZIONI ADERENTI 3. STRUTTURA E FUNZIONI DI DESMOSOMI ED EMIDESMOSOMI 4. MITOSI 2. FORMAZIONE
DEL FUSO MITOTICO 3. STRUTTURA E RUOLO DEL CINETOCORE 4. RUOLO DEL
CENTROSOMA E DEI MICROTUBULI 5. CITOCHINESI E DIVISIONE CELLULARE 6. ESEMPI
DI NON DIVISIONE O DI DIVISIONE CELLULARE ASIMMETRICA
AREA TEMATICA 20: MEIOSI 1. RUOLO E SIGNIFICATO BIOLOGICO DELLA MEIOSI 2.
ANALOGIE E DIFFERENZE TRA MEIOSI (I e II) E MITOSI 3. IL CROSSING-OVER E LA
RICOMBINAZIONE OMOLOGA 4. DIFETTI ED ALTERAZIONI FUNZIONALI DEI PROCESSI
MEIOTICI 5. MECCANISMI DI CONTROLLO DELLA DIVISIONE E CRESCITA CELLULARE
AREA TEMATICA 21: APOPTOSI 1. RUOLO E SIGNIFICATO BIOLOGICO DELLA MORTE
CELLULARE PROGRAMMATA 2. STRUTTURA E FUNZIONE DELLE CASPASI 3.
COMPONENTI E REGOLAZIONE DEL PATHWAY INTRINSECO 4. COMPONENTI E
REGOLAZIONE DEL PATHWAY ESTRINSECO 5. FATTORI DI SOPRAVVIVENZA ED
INIBIZIONE DEL PROCESSO APOPTOTICO
AREA TEMATICA 22: AUTOFAGIA 1. RUOLO E SIGNIFICATO BIOLOGICO DELLA
AUTOFAGIA 2. STRUTTURA E FUNZIONE DEGLI AUTOFAGOSOMI 3. MECCANISMI DI
REGOLAZIONE DELLA AUTOFAGIA 4. RUOLO DELLE PRINCIPALI PROTEINE ATGs 5.
RUOLO DEI RECETTORI DI CARICO E DELLA DEGRADAZIONE LISOSOMIALE
Modalità d'esame
L'esame consiste in una discussione orale su tutto il programma indicato nel Syllabus. Inoltre, gli studenti hanno a disposizione due prove intercorso che possono dare un voto proposto per l'esame finale. Le prove intercorso si considerano superate, ai fini del voto proposto, a partire da un minimo di risposte esatte pari a 17 su 30 domande. A compimento della seconda prova, gli studenti che hanno superato entrambe le prove avranno un voto proposto secondo le modalità che saranno illustrate in aula durante la lezione introduttiva. Coloro i quali hanno superato solo una delle due prove avranno la possibilità di svolgere una terza prova di recupero . Comunque, gli studenti avranno la possibilità di migliorare il voto proposto con l'esame orale o accedere direttamente all'orale, nel caso in cui le prove intercorso abbiano avuto esito negativo. In ogni caso, il voto proposto per il superamento delle prove intercorso e qualsiasi altro tipo di bonus sarà assegnato SOLO a chi ha frequentato il corso con assiduità. Pertanto, frequentemente alla fine delle lezioni verrà fatto l'appello in aula in modalità Random.
Le DRAB del lunedì e le tre prove intercorso daranno allo studente la possibilità di acquisire punti di
bonus per l'esame finale orale.
Testi di riferimento
Alberts, Biologia Molecolare della Cellula, VI edizione Zanichelli;
Iwasa e Marshal, Biologia cellulare e Molecolare di Karp, VI edizione EDISES;
Tutte le slides del corso sono messe a disposizione degli studenti su i siti ufficiali del corso
Codice insegnamento U7400